燃料電池バイク
燃料電池二輪車に関しては、2004年8月、本田技研工業が軽量・コンパクトな燃料電池システム「Honda FC STACK」を搭載したFCバイクを開発している。
2006年10月には、ヤマハ発動機もFCバイク「FC-AQEL」（エフシーアクエル）を開発しており、いずれも固体高分子型燃料電池（PEFC）を採用し、高圧水素タンクを搭載している。
スズキは「バーグマン フューエルセル スクーター」（空冷式固体高分子型燃料電池、容量：1.6kW、70MPaの高圧水素タンク搭載）を開発し、2009年から英国ラフバラ、2011年から北九州市で実証試験、2017年3月に型式認定を取得して公道走行を開始している。
しかし、いずれのFCバイク/スクーターも実証試験の域を出ず、販売には至っていない。
燃料電池バス
2011年、トヨタ自動車と日野自動車が、燃料電池（FC）ハイブリッドバスの開発を発表した。高圧水素ガス（35MPa）を燃料とするPEFC（出力：90kW×2台）と、ニッケル水素電池を動力源としてモーターを駆動するハイブリッドシステムである。
日野自動車は、東京都の支援を受け2015年に都営バによる実証試験を行っている。
2017年2月、トヨタ自動車がMIRAIに搭載するトヨタフューエルセルシステム（TFCS）を採用した「トヨタFCバス」を、東京都交通局に1億円で納車している。PEFC（出力：114kW×2台）と高圧水素タンク（70MPa、600L×10本）を搭載し、航続距離：200kmであった。
2018年3月には、図５に示すFCバス「SORA」の型式認証を取得し、販売を開始した。
2018年9月には、京浜急行バスがFCバス「SORA」の導入を決め、2019年春からお台場地区（東京都港区、品川区、江東区）で運行を開始している。蓄電池も搭載しており、非常時には最高出力：9kW、供給電力量：235kWhである。非常時などには、外部への電力供給も可能である。
FCバスの普及台数は、2021年３月末で合計104台（内都営バス70台）に達している。
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